Скачал сначала стим версию, потом установил M[FR]. В папке со стим версией всё удалил, закинул туда файлы M[FR], переименовал Morrowind.exe в Morrowind Launcher.exe, так как стим запускает именно его. Стандартный лаунчер в моде запускать не стоит, у меня лично разрешение менялось на 1280х800, поэтому стоит переименовать файлы, чтобы игра запускалась без лаунчера.